Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdhd2Q3UGR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdhd2Q3UGR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdhd2Q3UGR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdhd2Q3UGR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms