Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LbrQ3U9G9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LbrQ3U9G9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LbrQ3U9G9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LbrQ3U9G9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LbrQ3U9G9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LbrQ3U9G9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LbrQ3U9G9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms