Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops9Q3U898 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops9Q3U898 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 356.1 ms