Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtpbp6Q3U6U5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms