Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam117bQ3U3E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam117bQ3U3E2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam117bQ3U3E2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam117bQ3U3E2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam117bQ3U3E2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms