Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem35bQ3U0Y2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem35bQ3U0Y2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem35bQ3U0Y2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem35bQ3U0Y2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms