Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TraddQ3U0V2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TraddQ3U0V2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraddQ3U0V2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TraddQ3U0V2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.9 ms