Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KhsrpQ3U0V1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KhsrpQ3U0V1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KhsrpQ3U0V1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KhsrpQ3U0V1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KhsrpQ3U0V1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KhsrpQ3U0V1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms