Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn4clQ3TYX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn4clQ3TYX2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn4clQ3TYX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms