Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psmd1Q3TXS7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmd1Q3TXS7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psmd1Q3TXS7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Psmd1Q3TXS7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Psmd1Q3TXS7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms