Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam107bQ3TGF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam107bQ3TGF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam107bQ3TGF2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam107bQ3TGF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam107bQ3TGF2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms