Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hddc2Q3SXD3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hddc2Q3SXD3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms