Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF1Q3BBV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF1Q3BBV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF1Q3BBV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NBPF1Q3BBV0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NBPF1Q3BBV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF1Q3BBV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms