Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432.3 ms