Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Treml2Q2LA85 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml2Q2LA85 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Treml2Q2LA85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml2Q2LA85 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml2Q2LA85 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms