Protein–RNA interactions for Protein: Q24JQ0

TMEM241, Transmembrane protein 241, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM241Q24JQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM241Q24JQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM241Q24JQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM241Q24JQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM241Q24JQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM241Q24JQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM241Q24JQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM241Q24JQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms