Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q1T7F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q1T7F1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q1T7F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q1T7F1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q1T7F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q1T7F1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q1T7F1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q1T7F1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q1T7F1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q1T7F1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q1T7F1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q1T7F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q1T7F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q1T7F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q1T7F1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q1T7F1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q1T7F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q1T7F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q1T7F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q1T7F1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q1T7F1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q1T7F1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q1T7F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q1T7F1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q1T7F1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q1T7F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q1T7F1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q1T7F1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q1T7F1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q1T7F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q1T7F1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q1T7F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q1T7F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q1T7F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q1T7F1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q1T7F1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q1T7F1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q1T7F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Q1T7F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q1T7F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q1T7F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q1T7F1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q1T7F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q1T7F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q1T7F1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q1T7F1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q1T7F1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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