Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TXNRD1Q16881 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TXNRD1Q16881 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TXNRD1Q16881 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TXNRD1Q16881 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TXNRD1Q16881 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms