Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPPQ16740 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLPPQ16740 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPPQ16740 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPPQ16740 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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