Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF239Q16600 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF239Q16600 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF239Q16600 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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