Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF9Q16594 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF9Q16594 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF9Q16594 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF9Q16594 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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