Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD2Q16342 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD2Q16342 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD2Q16342 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCD2Q16342 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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