Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E2F4Q16254 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E2F4Q16254 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F4Q16254 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E2F4Q16254 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms