Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF56Q15929 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF56Q15929 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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