Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB11BQ15907 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11BQ15907 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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RAB11BQ15907 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RAB11BQ15907 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11BQ15907 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
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RAB11BQ15907 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RAB11BQ15907 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB11BQ15907 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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