Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ITSN1Q15811 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ITSN1Q15811 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITSN1Q15811 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITSN1Q15811 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ITSN1Q15811 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ITSN1Q15811 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
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