Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMGN3Q15651 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HMGN3Q15651 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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