Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
NCOA2Q15596 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.9
NCOA2Q15596 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NCOA2Q15596 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
NCOA2Q15596 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NCOA2Q15596 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NCOA2Q15596 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NCOA2Q15596 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
NCOA2Q15596 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA2Q15596 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA2Q15596 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA2Q15596 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA2Q15596 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms