Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18Q15532 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SS18Q15532 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18Q15532 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18Q15532 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18Q15532 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18Q15532 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SS18Q15532 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18Q15532 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18Q15532 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SS18Q15532 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18Q15532 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18Q15532 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18Q15532 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SS18Q15532 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SS18Q15532 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SS18Q15532 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18Q15532 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18Q15532 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18Q15532 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18Q15532 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18Q15532 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SS18Q15532 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SS18Q15532 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SS18Q15532 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SS18Q15532 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SS18Q15532 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SS18Q15532 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SS18Q15532 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18Q15532 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18Q15532 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18Q15532 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18Q15532 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SS18Q15532 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SS18Q15532 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18Q15532 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18Q15532 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18Q15532 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18Q15532 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18Q15532 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SS18Q15532 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SS18Q15532 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18Q15532 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18Q15532 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18Q15532 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SS18Q15532 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SS18Q15532 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18Q15532 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18Q15532 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18Q15532 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18Q15532 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SS18Q15532 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18Q15532 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18Q15532 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18Q15532 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18Q15532 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SS18Q15532 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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