Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBBP5Q15291 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBBP5Q15291 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBBP5Q15291 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBBP5Q15291 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.6 ms