Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC3Q15034 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC3Q15034 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERC3Q15034 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC3Q15034 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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