Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
R3HDM1Q15032 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
R3HDM1Q15032 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
R3HDM1Q15032 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
R3HDM1Q15032 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
R3HDM1Q15032 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
R3HDM1Q15032 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HDM1Q15032 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
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