Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCAPD2Q15021 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NCAPD2Q15021 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NCAPD2Q15021 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCAPD2Q15021 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCAPD2Q15021 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCAPD2Q15021 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms