Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIP12Q14669 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIP12Q14669 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP12Q14669 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP12Q14669 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP12Q14669 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP12Q14669 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP12Q14669 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP12Q14669 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP12Q14669 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIP12Q14669 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIP12Q14669 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms