Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLS1Q14651 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLS1Q14651 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLS1Q14651 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PLS1Q14651 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
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