Protein–RNA interactions for Protein: Q14257

RCN2, Reticulocalbin-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN2Q14257 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCN2Q14257 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN2Q14257 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN2Q14257 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCN2Q14257 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms