Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A2Q14055 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL9A2Q14055 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL9A2Q14055 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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