Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL3Q13618 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL3Q13618 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL3Q13618 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL3Q13618 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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