Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX1Q13596 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX1Q13596 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX1Q13596 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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