Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF4BQ13523 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF4BQ13523 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF4BQ13523 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF4BQ13523 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF4BQ13523 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
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