Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP3AQ13472 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP3AQ13472 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP3AQ13472 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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