Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNTA1Q13424 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTA1Q13424 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTA1Q13424 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTA1Q13424 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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