Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-205ENST00000593760 583 ntTSL 414.2□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 PSMD2-217ENST00000491149 895 ntTSL 211.32□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 24
G3BP1Q13283 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.82e-7■■■■□ 24
G3BP1Q13283 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.013e-9■■■■□ 24
G3BP1Q13283 CCDC86-202ENST00000535217 1488 ntTSL 521.29■■□□□ 12e-8■■■■□ 24
G3BP1Q13283 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-8■■■■□ 24
G3BP1Q13283 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 24
G3BP1Q13283 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.487e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 227.76■■■□□ 2.037e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 226.02■■□□□ 1.767e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ARAP1-212ENST00000536885 639 ntTSL 224.15■■□□□ 1.467e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 323.71■■□□□ 1.397e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.347e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-203ENST00000418841 582 ntTSL 323.03■■□□□ 1.287e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 222.12■■□□□ 1.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-211ENST00000600746 999 ntTSL 521.71■■□□□ 1.077e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.967e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-213ENST00000601098 783 ntTSL 320.35■□□□□ 0.857e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ARAP1-214ENST00000541623 533 ntTSL 519.88■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-203ENST00000593887 695 ntTSL 519.82■□□□□ 0.767e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.727e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 519.49■□□□□ 0.717e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-218ENST00000568205 463 ntTSL 219.49■□□□□ 0.717e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-207ENST00000526711 1594 ntTSL 219.4■□□□□ 0.77e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-214ENST00000575206 590 ntTSL 319.12■□□□□ 0.657e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.657e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.647e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-209ENST00000468539 562 ntTSL 418.7■□□□□ 0.587e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 318.33■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-212ENST00000492901 545 ntTSL 417.86■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 517.82■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.397e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-203ENST00000561702 2042 ntTSL 217.37■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-207ENST00000455636 570 ntTSL 317.12■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.277e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 216.48■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 COG4-214ENST00000567244 723 ntTSL 316.22■□□□□ 0.197e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-211ENST00000530016 1696 ntTSL 215.42■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-211ENST00000565370 686 ntTSL 315.21■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-208ENST00000464528 4432 ntTSL 215.06■□□□□ 07e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.17e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 LANCL1-206ENST00000448951 808 ntTSL 314.39□□□□□ -0.117e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-222ENST00000569820 2305 ntTSL 514.25□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 514.24□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 CNDP2-215ENST00000581912 551 ntTSL 413.59□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-214ENST00000534706 790 ntTSL 512.8□□□□□ -0.367e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-206ENST00000526318 596 ntTSL 312.77□□□□□ -0.377e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 GLOD4-209ENST00000574581 677 ntTSL 311.87□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-207ENST00000554812 1279 ntTSL 211.09□□□□□ -0.637e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-209ENST00000528784 947 ntTSL 211.07□□□□□ -0.647e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.997e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-203ENST00000553665 925 ntTSL 28.3□□□□□ -1.087e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-209ENST00000555931 606 ntTSL 48.05□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-208ENST00000555743 640 ntTSL 27.63□□□□□ -1.197e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ANXA4-203ENST00000418066 905 ntTSL 37.58□□□□□ -1.27e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.217e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 OSBP-202ENST00000525357 991 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.317e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-210ENST00000556321 500 ntTSL 25.76□□□□□ -1.497e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.577e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-211ENST00000557087 654 ntTSL 34.54□□□□□ -1.687e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 NCAPD2-204ENST00000536090 654 ntTSL 214.32□□□□□ -0.125e-23■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 NCAPD2-211ENST00000542472 444 ntTSL 34.53□□□□□ -1.685e-23■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 CLTC-203ENST00000466513 793 ntTSL 25.53□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 HSD17B4-211ENST00000508788 446 ntTSL 47.71□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 HSD17B4-207ENST00000505181 417 ntTSL 57.35□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 CLTC-207ENST00000483176 760 ntTSL 35.9□□□□□ -1.464e-10■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.472e-11■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 PHGDH-234ENST00000642041 943 nt21■□□□□ 0.956e-8■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 PHGDH-221ENST00000641573 1180 nt16.15■□□□□ 0.186e-8■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.098e-10■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 310.38□□□□□ -0.758e-10■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 28.68□□□□□ -1.028e-10■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.738e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.988e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.638e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.518e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.58e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.288e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-203ENST00000381653 1446 ntTSL 527■■□□□ 1.914e-7■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-205ENST00000470376 845 ntTSL 326.82■■□□□ 1.884e-7■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-212ENST00000555568 863 ntTSL 322.23■■□□□ 1.154e-7■■■■□ 23.7
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