Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.037e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 AP1G2-220ENST00000555896 927 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.247e-13■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-222ENST00000489772 1384 ntTSL 26.83□□□□□ -1.324e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.764e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 315.23■□□□□ 0.032e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 310.73□□□□□ -0.692e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 210.3□□□□□ -0.762e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.122e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.312e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.382e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.412e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.422e-24■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 314.14□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 22
SRSF9Q13242 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.732e-7■■■■□ 22
SRSF9Q13242 MRPL20-202ENST00000477686 314 ntTSL 39.25□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 22
SRSF9Q13242 MRPL20-204ENST00000487659 1693 ntTSL 29.25□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 22
SRSF9Q13242 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-8■■■■□ 22
SRSF9Q13242 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.69□□□□□ -0.225e-8■■■■□ 22
SRSF9Q13242 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.365e-8■■■■□ 22
SRSF9Q13242 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.365e-8■■■■□ 22
SRSF9Q13242 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.445e-8■■■■□ 22
SRSF9Q13242 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.795e-8■■■■□ 22
SRSF9Q13242 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.519e-8■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 12e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-205ENST00000431834 1612 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-204ENST00000403696 789 ntTSL 315.15■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-209ENST00000457960 881 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-212ENST00000477331 1041 ntTSL 212.23□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-210ENST00000459857 560 ntTSL 412.2□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-213ENST00000492289 735 ntTSL 311.68□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-206ENST00000432186 905 ntTSL 211.07□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-207ENST00000432916 1430 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-ARHGAP8-204ENST00000515632 1590 ntTSL 29.63□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-ARHGAP8-203ENST00000495250 1271 ntTSL 29.24□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 PRR5-214ENST00000492475 920 ntTSL 58.81□□□□□ -12e-6■■■■□ 21.8
SRSF9Q13242 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 21.7
SRSF9Q13242 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 21.7
SRSF9Q13242 NCOA5-202ENST00000372291 727 ntTSL 315.19■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 21.7
SRSF9Q13242 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 21.7
SRSF9Q13242 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 54.84□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 21.7
SRSF9Q13242 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.595e-10■■■■□ 21.6
SRSF9Q13242 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.635e-10■■■■□ 21.6
SRSF9Q13242 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.655e-10■■■■□ 21.6
SRSF9Q13242 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.755e-10■■■■□ 21.6
SRSF9Q13242 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-10■■■■□ 21.6
SRSF9Q13242 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-206ENST00000559075 1735 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-214ENST00000534606 627 ntTSL 314.21□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-204ENST00000527089 824 ntTSL 313.6□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-201ENST00000267950 1289 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-215ENST00000560595 917 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-207ENST00000540763 799 ntTSL 311.93□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-213ENST00000475890 2080 ntTSL 511.75□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-209ENST00000530183 530 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-206ENST00000528315 575 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-211ENST00000560044 1054 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-211ENST00000530737 834 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-204ENST00000536079 765 ntTSL 210.98□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-209ENST00000542286 2767 ntTSL 210.96□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-218ENST00000560899 910 ntTSL 510.64□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-218ENST00000491654 578 ntTSL 510.42□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-204ENST00000379850 2379 ntTSL 510.18□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-212ENST00000533803 742 ntTSL 210.06□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-212ENST00000544738 956 ntTSL 510.02□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-202ENST00000354291 1004 ntTSL 59.84□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-220ENST00000548698 455 ntTSL 59.81□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CRACR2B-213ENST00000534191 1154 ntTSL 29.69□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 DDX55-206ENST00000539934 2240 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-205ENST00000424845 558 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-206ENST00000424990 565 ntTSL 48.87□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 21.5
Retrieved 100 of 3,885 protein–RNA pairs in 328.2 ms