Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENBP1Q13228 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENBP1Q13228 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENBP1Q13228 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SELENBP1Q13228 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENBP1Q13228 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms