Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1H3Q13133 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1H3Q13133 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NR1H3Q13133 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
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