Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACACAQ13085 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACACAQ13085 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACACAQ13085 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACACAQ13085 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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