Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPB3Q12988 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPB3Q12988 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB3Q12988 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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