Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXC1Q12948 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXC1Q12948 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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