Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFSWAPQ12872 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFSWAPQ12872 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SFSWAPQ12872 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SFSWAPQ12872 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFSWAPQ12872 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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